哈索尔神庙中埃及艳后和恺撒里昂的浮雕
前47年6月23日，恺撒里昂出生于托勒密王朝统治下的埃及首都亚历山大里亚的皇宫里。当时，他的母亲克利奥帕特拉七世22岁，父亲尤利乌斯·恺撒50岁，但两人没有结婚，所以他是私生子。他母亲是古希腊人，父亲是古罗马人，所以他是希腊和罗马的结晶，没有丝毫古埃及人的血统。克利奥帕特拉女王对外宣称恺撒是她儿子的父亲，并且希望恺撒指定恺撒里昂为尤利乌斯家族的继承人和罗马共和国未来的领袖。但是恺撒拒绝了，他选择了他的甥孙和养子屋大维。而恺撒里昂则被预定为名义上的埃及和罗马、东方和西方共同的统治者（指克利奥帕特拉和恺撒）的继承人，但是这个身份徒有虚名，随着恺撒的遇刺化为乌有。
恺撒里昂出生不久，就随父母一起来到了罗马共和国的首都罗马（今意大利首都罗马市）。从前47年到前44年，他和父母都在罗马。而前44年3月 15日其父恺撒遇刺时，他和母亲也很可能仍在罗马，并亲历此事。 恺撒遇刺后，女王母子马上回到埃及。前44年7月26日，女王的弟弟、名义上的丈夫和共治国王托勒密十四世死于恶疾（也有说法他是被女王毒死的。），女王开始单独执政。同年9月2日，女王立儿子恺撒里昂为共治国王（法老）。
在罗马，恺撒遇刺后，养子屋大维和部将马克·安东尼、雷必达三人联合组成后三头同盟，消灭了共同的敌人共和派，并瓜分了共和国的最高权力。把雷必达排挤后，屋大维为了笼络安东尼，让他统治共和国东方的领土，还把妹妹屋大维娅嫁给他。但前42年，安东尼和女王在塔尔苏斯邂逅，和恺撒一样为女王的美色所惑，两人很快追入情网，开始在亚历山大里亚实行联合统治，还生了一个儿子和一个女儿，把屋大维娅抛之脑后。安东尼实际上成了恺撒里昂的继父。为了巩固统治，安东尼和女王下令杀掉了被囚禁的前敌对女王阿西诺亚四世。不过安东尼在亚历山大里亚待了没多久，便离开埃及开始东征帕提亚。
